Deep Instinct נוסדה ב-2015 על ידי גיא כספי, ד"ר אלי דוד ונדב ממן, והציעה גישה שהייתה חריגה בזמנה לתחום אבטחת-הסייבר.
מוצרי אבטחה רבים כבר השתמשו אז בלמידת-מכונה, אך בגרסתה הקלאסית: מומחה אנושי מגדיר מראש אילו מאפיינים כדאי למדוד בקובץ — גודלו, סוג האריזה שלו, אילו פונקציות מערכת הוא קורא — והאלגוריתם לומד לסווג לפי המאפיינים האלה. החולשה ברורה: התוקפים לומדים אילו מאפיינים נמדדים ומתאימים את עצמם. Deep Instinct ויתרה על שלב ההגדרה האנושי ואימנה רשת עצבית עמוקה ישירות על הקבצים הגולמיים, בהסתמך על כך שהרשת תמצא בעצמה את הסימנים המבדילים — אותו מעבר שהתרחש קודם לכן בזיהוי תמונות ובעיבוד שפה. בשילוב עם חומרת מעבדים גרפיים לאימון, המטרה המוצהרת הייתה לחסום קובץ עוד לפני שהורץ, ולא לזהות פעילות חשודה אחריה.
בין אבני-הדרך: פרס "חלוץ טכנולוגי" של הפורום הכלכלי העולמי ב-2017; כניסתה של אנבידיה כמשקיעה ביולי אותה שנה; ושיתוף-פעולה עם HP ב-2019, שבמסגרתו שולבה הטכנולוגיה במוצר האבטחה HP Sure Sense שנמכר עם מחשבי החברה — סוג של אישור מסחרי שקשה להשיג לחברה צעירה.
מבחינת גיוסים, החברה גייסה 43 מיליון דולר בסבב C בפברואר 2020, ובאפריל 2021 סבב D של 100 מיליון דולר בהובלת ענקית ההשקעות BlackRock. נכון ל-2026 היא אחת מהחברות הישראליות המעטות בקטגוריה הזו שיש עליה ערך אנציקלופדי עצמאי, ואחת הדוגמאות המוקדמות לשימוש בלמידה עמוקה כמוצר-אבטחה ולא ככלי-עזר.
נקודה שראוי לציין היא שהוויכוח על עדיפות הלמידה העמוקה בסייבר לא הוכרע חד-משמעית: יריבותיה טענו שהגישה יקרה יותר במשאבים ופחות שקופה, שכן קשה להסביר מדוע רשת עמוקה חסמה קובץ מסוים. זו אותה שאלת שקיפות שמלווה את הלמידה העמוקה בכל תחום שבו היא מחליטה החלטות בעלות משמעות.